光学表征和显微成像

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  荧光成像 基础知识   The Rayleigh Criterion 角分辨率 Numerical Aperture and Image Resolution交互动画 分辨率Resolution 几种超分辨率荧光显微技术的原理和近期进展 生物荧光成像技术介绍——多姿多彩的单、双光子成像技术 宽场落射荧光/激光共聚焦荧光显微成像 光学荧光成像(Optical Fluorescence Microscopy): 多色标记; 动态成像,因为光相比于电子来说,对生物样品的损伤小很多,而且光学成像的时间分辨率很高,所以可以用光学荧光成像技术对活细胞或活生物样品进行长时间的观察,这样就可以捕捉动态的生命过程,比如细胞的分裂、迁移,药物进入细胞的机制以及进入后的动力学行为等等; 分辨率相对较低,艾里斑和点扩散函数的存在也会造成图像的模糊和清晰度的下降。 下面这几条都是荧光成像相关的基础知识,参考Fluorescence microscope—Wiki 光源:xenon arc lamp or mercury-vapor lamp are common; more advanced forms are high-power LEDs and lasers. Multi-color image: The filters and the…

生物医学

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免疫系统常识 western blot 免疫荧光 常规DNA的复制 常规DNA的复制如下图:【半保留复制】(semiconservative replication) 【解旋酶】(Helicase) 【拓扑异构酶】(Topoisomerase) 【导引酶】(Primase,也叫引物酶、引子酶) 【逆转录酶】(Reverse transcriptase) 【聚合酶】(polymerase):主要是连接DNA片段与单个脱氧核苷酸之间的磷酸二酯键, 在DNA复制中起做用 【Taq聚合酶】(Taq polymerase) 【连接酶】(ligase):主要是连接DNA片段之间的磷酸二酯键, 起连接作用, 在基因工程中起作用 【限制酶】(Restriction enzyme) RT-PCR 实时荧光定量RT-PCR方法,核酸检测大体可以分为四个步骤: 第一步:提纯核酸 冠状病毒有蛋白质外壳、刺突、内部遗传物质(RNA,或者叫作核糖核酸)。采用裂解的方法,加入一些溶液,把外边的蛋白质外壳融掉,然后进行洗涤、离心等等,将RNA富集起来,得到比较纯的RNA。注意用棉签捅了嗓子眼之后,其实得到的主要是嗓子这个地方的上皮细胞,因此人体的DNA和RNA也会混杂在里面;另外如果这个人感染了像感冒这样的病毒,其DNA或者RNA也会在里面。有这么多RNA或者DNA,如何知道这里面有没有新冠病毒的RNA呢? 第二步:逆转录 【中心法则】(Central dogma of molecular biology):以DNA (脱氧核糖核酸,A-T/C-G)为模板,根据碱基互补配对原则,合出一个单链的RNA (A-U/C-G),即转录,然后此RNA进入核糖体,翻译DNA的遗传密码,指导蛋白质的生产。 类比: DNA是厂长,制定生产计划; RNA是车间主任,厂长告诉他生产什么,他就生产什么; 车间主任来到车间(核糖体),告诉核糖体怎么把这些氨基酸组成蛋白质。 注: (1) 中心法则是由DNA双螺旋结构的发现者之一克里克于1958年提出,并且于1970年在Nature的一篇文章中重申:The central dogma of molecular biology deals with…

忆阻器和蔡氏电路

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  参考资料: (1) 周末搭了个蔡氏电路,体验一下“狐狸精” (2) 一种最简的并行忆阻器混沌系统—物理学报—2013 (3) Multisim 研究蔡氏电路的混沌效应—B站视频 (4) 混沌与蔡氏电路—B站视频  

各种导体

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  混合导体 混合导体(mixed conductors)也叫混合离子-电子导体(mixed ion-electron conductors,MIEC), 常见的混合导体有SrTiO3,TiO2,CeO2,LiFePO4,LiMnPO4等等 https://www.fkf.mpg.de/2698712/MixedConductors 质子导体 快离子导体 氧离子导体

双线性

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双线性映射 【双线性映射】(bilinear map):In mathematics, a bilinear map is a function combining elements of two vector spaces to yield an element of a third vector space, and is linear in each of its arguments. Matrix multiplication is an example. Let \(V, W\) and \(X\) be three vector spaces…

范畴论

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书籍和工具: 在线绘制交换图 Seven Sketches in Compositionality: An Invitation to Applied Category Theory  Conceptual Mathematics: A First Introduction to Categories category theory—nLab 应用范畴论的网站 Category Theory: The Beginner's Introduction   2 MIT— 18.S097: Programming with Categories 范畴和态射 【范畴】是由一些对象及其间的箭头(称为态射,或者关系)组成的结构,通常用来描述某一类数学对象及其间的映射全体。范畴为数学提供了一个模板,将不同内容输入模板,就能重建一个数学领域。例子如下: 集合范畴由所有集合和它们之间的映射(关系)组成; 向量空间范畴由所有向量空间和它们之间的线性映射组成; 群范畴由群和它们之间的关系(群同态)组成; 拓扑空间范畴由拓扑空间和它们之间的关系(连续映射)组成; 范畴论的特点: 范畴论是一门关于箭头(态射)的科学,箭头是用来连接两个点(对象)的。 范畴论是一门元关系(meta-relation)学科。 不同领域的问题,如果具有相似的关系,在范畴论便可以统领(套路)。 借助范畴论的各种套路,可以把某个领域的问题转化为其它领域的问题(函子)。 范畴的定义: 函子: 参考香蕉空间…

抽象代数基础

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  交换/结合/分配律 【交换律】(Commutative property ):是一个和二元运算及函数有关的性质。而若交换律对一特定二元运算下的一对元素成立,则称这两个元素为在此运算下是"可交换"的。 在集合\(S\)的一个二元运算 \(*\) 被称之为"可交换"的,若\(\forall x, y \in S, x * y=y * x\); 若称\(x \)在 \(*\) 下和\(y\)可交换,即表示\(x* y=y * x\); 二元函数\(f: A \times A \rightarrow B\)被称之为可交换的,若\(\forall x, y \in A, f(x, y)=f(y, x)\)。此函数图像会对\(y=x\)对称。 可交换的例子: 实数的加法、乘法,复数的乘法; 更广义地说,在一个域中,加法和乘法都是可交换的; 集合的交集与并集、"与"和"或"的可交换的逻辑运算; 加法在每个向量空间和每个代数中都是可交换的; 阿贝尔群的群运算; 域的加法与乘法都是可交换的; 交换环是一个乘法为可交换的环。 不可交换的例子: 洗衣和干衣;…

量子力学

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视频    笔记        Hyperphysics-Quantum mechanics Measurements in Quantum Mechanics 陈童的量子新世界 深度科普|从线性代数到量子力学 简明量子力学-推荐 量子力学-ustc-潘建伟 量子力学导论—知乎专栏 Graduate Quantum Mechanics Lectures 演示动画Applet    Brant Carlson视频 量子场论-参考余钊焕老师讲义   波函数 When does quantum mechanics apply? this is not a simple question. When angular momentum \(L \sim \hbar\) When uncertainties \(\Delta p…

会议学习总结

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物理 硅光 常见材料的折射率  Si:3.882 @632.8 nm SiO2:1.457@632.8 nm Si3N4:2.023@632.8 nm Al2O3:1.770@632.8 nm 技术挑战(Technological Challenges) Si的发光非常inefficient,因为它是间接带隙的材料,尽管人们采用各种方法去get around这个缺陷,但是基于Si的laser或者放大器的性能和其他基于其他材料的(比如GaAs或者InP)的还有不小的差距; Si的禁带宽度还是太大了,使其不能探测通讯波段的1.3 μm和1.5 μm的光; Si没有二阶非线性效应,使得这个材料不能实现electro-optic modulators (EOM); The heat dissipated by a laser source on a chip might well be more than is convenient. 目前可能的是办法是制备hybrid devices,由三五族的半导体(直接带隙,有electro-optic properties,比如InP)来实现photonic functions,将其放置在含有各种electronic components的silicon chip上。一类技术基于外延再生长程序,该程序很复杂并且经常大大降低产量。另一种方法是应用复杂的键合工艺将包含波导的硅芯片与提供光学增益的磷化铟芯片结合起来[17]。在这里,需要两个芯片之间的精确对齐。Both technical approaches,…

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